המכון לגסטרואנטרולוגיה ותזונה ילדים במרכז הרפואי שערי צדק הוא אחר משני המרכזים הגדולים מסוגם בישראל. הוא כולל מספר מרכזי מצוינות המתמחים במגוון רב של מחלות. המכון מאכלס את אחת מיחידות המחקר הגדולות ביותר בגסטרואנטרולוגיה ילדים באירופה.
תחומי אחריות עיקריים:
- ניתוח אומיקס ורב-אומיקס: ביצוע ניתוחים פרטניים ומשולבים על מערכי נתונים של גנטיקה, טרנסקריפטומיקה, מיקרוביום, מטבולומיקה ופרוטאומיקה שנוצרו ממחקרים מתמשכים שלנו.
- ניהול צינורות ניתוח ופלטפורמות: תחזוקה, שיפור ואופטימיזציה של צינורות נתונים אנליטיים ותשתיות נתונים קיימות בתחום.
- מודל ניבוי: פיתוח, הערכה ופריסה של מודלים ניבויים באמצעות אלגוריתמים של למידת מכונה וכלי ביואניפורמטיקה מתקדמים המותאמים למערכי נתונים קליניים של רב- אומיקס.
- מחקר שיתופי: עבודה בשיתוף פעולה הדוק עם קלינאים, חוקרים ומנהלי נתונים כדי לפרש ממצאים ולתמוך בפרסומים אקדמיים ובבקשות למענקים קליניים.
דרישות:
- תואר שני או דוקטורט בביואינפורמטיקה, ביולוגיה חישובית, מדעי מחשב או תחום קשור אחר.
- ניסיון מוכח באינטגרציה וניתוח של נתונים רב- אומיקס (למשל מיקרוביום, טרנסקריפטומיקה, מטבולומיקה).
- ניסיון מעשי עם שפות תכנות סטטיסטיות (R, Python ) וסביבות לינוקס/ יוניקס.
- הבנה מוצקה של עקרונות למידת מכונה המיושמים על נתונים ביולוגיים/קליניים. כישורי תקשורת חזקים ויכולת לעבוד באופן עצמאי בצוות קליני רב- תחומי. המשרה מיועדת לנשים ולגברים כאחד.
